创新仍然是阿尔巴尼亚工业面临的主要挑战之一。阿国家工业战略（2026-2030）指出，阿研发支出仅占国内生产总值（GDP）的0.30%，远低于欧盟2.24%的平均水平。阿国家工业战略的目标是到2030年，使这一指标至少达到GDP的1%。该文件强调，阿创新体系的特点是科学研究与制造业之间存在严重的脱节。该战略设想阿通过技术转移中心、应用研究项目和联合融资机制，加强产学研合作。

该战略另一个目标是提高阿私营部门在创新领域的参与度。该战略强调，到2026年，阿尚未向“地平线欧洲”计划提交任何申请。这显示出阿目前面临的挑战不仅在于资金短缺，还在于缺乏制定具有竞争力的项目和吸收国际资金的能力。